Načrtovanje in vstavljanje poligenskih lastnosti v S. cerevisiae
Oznaka in naziv projekta
J4-4560 Načrtovanje in vstavljanje poligenskih lastnosti v S. cerevisiae
J4-4560 Engineering polygenic traits in S. cerevisiae
Logotipi ARIS in drugih sofinancerjev
Projektna skupina
Vodja projekta: prof. dr. Uroš Petrovič
Sodelujoče raziskovalne organizacije: Povezava na SICRIS
Sestava projektne skupine: Povezava na SICRIS
Vsebinski opis projekta
Vsebinski opis projekta
Kvasovka Saccharomyces cerevisiae se uporablja kot evkariontski modelni organizem v temeljnih raziskavah in za biotehnološke aplikacije.
Na tisoče različnih sevov kvasovk S. cerevisiae je shranjenih v zbirkah mikroorganizmov in zaradi svoje genetske raznolikosti predstavljajo izjemen nabor fenotipske variabilnosti. Večina biotehnološko pomembnih fenotipov, kot sta odpornost proti različnim okoljskim stresom in učinkovitost pri tvorbi določenih metabolitov ali proteinov, je poligenskih. Zato identifikacija genov, ki prispevajo k takšni lastnosti, ni tako preprosta kot pri monogenskih lastnostih. Vendar pa je v zadnjih dveh desetletjih razvoj naprednih metod za analizo in urejanje genomov, skupaj z razpoložljivostjo velikih zbirk sevov, utrl pot za karakterizacijo vzročnih alelov za kompleksne oziroma poligenske lastnosti in za njihov hiter prenos v kateri koli sev iste vrste. V tem projektu si prizadevamo pridobiti optimalni nabor genov oziroma alelov za več poligenskih lastnosti, z izkoriščanjem genetske in fenotipske raznolikosti velikega nabora sevov kvasovk S. cerevisiae. Rezultati bodo uporabljeni za optimizacijo sevov, ki so bili predhodno razviti za sintezo produktov biotehnološkega pomena.
Izbrali bomo nabor genetsko in fenotipsko različnih sevov iz zbirke več kot 1,000 sevov S. cerevisiae, da bi raziskali dve biotehnološko pomembni lastnosti. Rezultati te prelomne študije ne bodo samo izboljšali našega razumevanja preiskovanih lastnosti, ampak bodo tudi pokazali potencial uporabe velikih zbirk sevov za takšne študije na splošno.
Osnovni podatki sofinanciranja so dostopni na spletni strani SICRIS.
Faze projekta in opis njihove realizacije
1. Faza
Izbor, priprava in fenotipska analiza starševskih in vhodnih sevov
2. Faza
Identifikacija vzročnih genov
3. Faza
Prenos vzročnih alelov za preiskovane lastnosti v industrijske seve in analiza pridobljenih novih sevov